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Message par StephaniePi le Ven 14 Sep 2012 - 13:19

Bonjour à tous,
Je viens sur ce forum chercher de l'aide !

J'ai 87 gènes qui m'intéressent. Je regarde ceux ciblés par un petit ARN : j'en ai 20/87 soit 23%
je fais une manip contrôle dans laquelle je crée une banque de petit ARN en changeant les positions de tous les nucléotides de la séquence originale.
Sur les 87 gènes, j'ai maintenant 8 gènes ciblés par mes randoms petits ARNs soit 9%

Comment puis je montrer que cette diminution d'ARN cibles dans l'expérience random est statistiquement significative (ou pas) ...

Je souhaite faire cela avec R ...

Merci d'avance pour votre aide !

StephaniePi

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Message par gg le Ven 14 Sep 2012 - 15:17

Bonjour.

Déjà pas en comparant les pourcentages seuls, jamais significatifs en tant que tels, mais en comparant les effectifs, par exemple avec un test de khi-deux. En comparant les séries 20 67 et 8 79.

Cordialement.

gg

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Message par StephaniePi le Ven 14 Sep 2012 - 15:21

Merci pour votre réponse,
j'ai fait ceci, est ce juste ?
Code:
> x =c(20,67)
> y = c(8,79)
> MAT <- matrix(c(x,y), ncol=2)
> chisq.test(MAT)

        Pearson's Chi-squared test with Yates' continuity correction

data:  MAT
X-squared = 5.1502, df = 1, p-value = 0.02324

StephaniePi

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Message par StephaniePi le Lun 17 Sep 2012 - 13:29

Est ce bien comme ceci que je dois procéder ?

StephaniePi

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Message par gg le Lun 17 Sep 2012 - 13:59

Je n'en sais rien ! Je ne connais pas le logiciel que tu utilises (il y a une partie du forum dédiée).

Cordialement.

gg

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Message par StephaniePi le Lun 17 Sep 2012 - 14:02

ok merci

StephaniePi

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Date d'inscription : 14/09/2012

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