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Petite aide interprétation Test exact de Fisher R

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Message par Daniden le Mer 30 Mai 2012 - 7:47

Bonjour, est ce que vous pouvez valider ma conclusion s'il vous plait?

La proportion de famille obtenue sur les deux échantillons est différente
bien cordialement


Code:
                        BGP1s11 BGP2s11
Acanthuridae    8.1666667    0.6
Albulidae        0.0000000    0.0
Antennariidae    0.0000000    0.2
Apogonidae      14.0000000    35.6
Aulostomidae    1.3333333    0.2
Balistidae      0.5000000    0.0
Blenniidae      8.6666667    1.6
Bothidae        0.5000000    0.0
Carangidae      0.0000000    0.0
Chaetodontidae  2.6666667    3.0
Cirrhitidae      0.0000000    0.0
Cirritidae      0.0000000    0.0
Coryphaenidae    0.0000000    0.0
Dactylopteridae  0.0000000    0.2
Diodontidae      0.0000000    0.0
Fistulariidae    6.6666667    2.4
Gobiidae        0.0000000    0.0
Hemiramphidae    0.3333333    0.0
Holocentridae    6.0000000    1.6
Kuhliidae        0.3333333    0.0
Labridae        0.0000000    0.0
Lethrinidae      0.0000000    0.0
Lutjanidae      0.1666667    0.2
Malacanthidae    0.0000000    0.0
Microdesmidae    1.1666667    0.4
Monacanthidae    4.0000000    1.4
Mugilidae        0.0000000    0.0
Mullidae        5.1666667    4.4
Muraenidae      0.0000000    0.2
Nomeidae        0.1666667    0.0
Ostraciidae      0.3333333    0.4
Polynemidae      0.1666667    0.0
Pomacanthidae    0.0000000    0.0
Pomacentridae  26.5000000    84.2
Priacanthidae    0.0000000    0.0
Scorpaenidae    0.1666667    4.2
Serranidae      0.0000000    0.0
Siganidae        0.0000000    0.0
Solenostomidae  0.0000000    0.0
Sphyraenidae    0.0000000    0.0
Syngnathidae    0.3333333    0.0
Synodontidae    0.5000000    0.6
Tetraodontidae  0.0000000    0.4
> fisher.test(poulin,hybrid=T)

        Fisher's Exact Test for Count Data

data:  poulin
p-value = 2.124e-08
alternative hypothesis: two.sided

Message d'avis :
In fisher.test(poulin, hybrid = T) :
  'x' a été arrondi à un entier Mean relative difference: 0.05741076


Daniden

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Message par Yonyon le Mer 30 Mai 2012 - 12:07

La p-value te permet de dire si tu rejette l'hypothèse nulle H0 ou pas (avec 5% d'erreur). Ici, elle est inférieure à 5% donc tu rejettes H0: proportion identique. Donc ta conclusion est bonne Smile

Logiquement c'est ça, après il y a peut être une subtilité qui m'a échappée... ^^
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Message par Daniden le Mer 30 Mai 2012 - 14:08

Ok merci , Yonyon en fait je doutais de l'utilisation du test exact de Fisher pour ce genre de données, mais apparemment ça ne te choques pas. :-)

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Message par joyeux_lapin13 le Mer 30 Mai 2012 - 15:51

hmmm... Dans le doute, pour qu'on puisse te dire si le test que tu as utilisé est bon il faudrait peut-être que tu nous expliques par exemple ce que représente une de tes cellules (% de l'espèce au sein des catégories BGP1s11 et BGP2s11? ou % de BGP1s11 et BGP2s11 pour chaque espèce? car dans ce cas au vue des répartitions théoriques ton test semble en effet correcte).
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Message par Daniden le Mer 30 Mai 2012 - 17:21

joyeux_lapin13 a écrit:hmmm... Dans le doute, pour qu'on puisse te dire si le test que tu as utilisé est bon il faudrait peut-être que tu nous expliques par exemple ce que représente une de tes cellules (% de l'espèce au sein des catégories BGP1s11 et BGP2s11? ou % de BGP1s11 et BGP2s11 pour chaque espèce? car dans ce cas au vue des répartitions théoriques ton test semble en effet correcte).

Salut Joyeux lapin,
Il s'agit de l'effectif brut de chaque familles au sein des categories BGP1s11 et BGP2s11 et non du pourcentage...Est ce toujours correcte Rolling Eyes ?

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Message par joyeux_lapin13 le Mer 30 Mai 2012 - 17:37

Pourquoi des nombres décimaux s'il s'agit d'effectifs?
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Message par Daniden le Mer 30 Mai 2012 - 18:11

BGP1s11 represente un site echantillonné pendant 6 jours et bgp2s11 represente un site echantillonné sur 5 jours.C'est donc une abondance de chaque familles capturees sur 1 jour. Ça peut poser un soucis les virgules? Il faut peut etre utiliser les pourcentages? Merci

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Message par joyeux_lapin13 le Mer 30 Mai 2012 - 18:53

Non pas de soucis mais voilà faut pas faire un test de Fisher sur des données de format continue, mais bon si tu es sur qu'il s'agit bien d'effectifs alors c'est Ok.
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Message par Daniden le Jeu 31 Mai 2012 - 2:26

Merci beaucoup joyeux lapin . Est ce qu'il y a moyen de faire un petit don de temps à autre aux personnes qui gerent le forum? Toi en occurence qui passe pas mal de temps a repondre aux questions.

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Message par joyeux_lapin13 le Jeu 31 Mai 2012 - 7:49

Salut, désolé mais je ne comprends pas ce que tu veux dire par:
faire un petit don de temps à autre aux personnes qui gerent le forum

Parles-tu d'intégrer la modération?
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