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Manipulation des données après importation d'excel

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Message par Matangi le Jeu 11 Aoû 2011 - 22:08

Bonjour,
Je débute avec R et j'ai donc quelques difficultés à utiliser le logiciel. L'expérience est la suivante je veux comparer la croissance de larves de crustacés de 2 pools de géniteurs d'origine différentes. Pour cela j'ai des triplicats de bassin pour chaque pool. Les crustacés ont une croissance discontinue (mue). Il y a 12 stades larvaires. j'ai donc 90 données par pool par stades. J'ai créé un fichier excel pour chaque stade. Il y a un tableau à 2 colonnes "V1" et "V2". Dans chaque colonne il y a 90 mesures. Je voudrais savoir si il y a une différence significative. Pour chaque stade.

#J'ai transformé les fichier en .csv et utilisé la commande
>stage10<-read.csv(Fichier,header=TRUE,sep=";",dec=",")
#ensuite pour visualiser les données je tape
>stage10
V1 V2
1 1.750 1.575
2 1.700 1.500
3 1.750 1.650
4 1.750 1.675
5 1.700 1.375
6 1.725 1.625
7 1.775 1.700
8 1.625 1.750
9 1.625 1.700
10 1.725 1.575
...
#maintenant je voudrais faire un t-test
>t.test[V1,V2]
#ça me met une erreur
Erreur : objet 'V1' introuvable

Comment dois je faire pour qu'il considère la colonne V1 comme un objet?
Pensez vous qu'une comparaison de moyenne est suffisante ou vaut il mieux faire une ANOVA?

Merci

Matangi

Nombre de messages : 4
Date d'inscription : 08/07/2010

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Message par Hadrien35 le Ven 12 Aoû 2011 - 7:05

Plusieurs solutions... En vrac car je n'ai pas essayé...

- Utiliser les parenthèses
Code:
resultat <- t.test(V1,V2)

- Spécifier l'origine des données
Code:
resultat <- t.test(x=V1, y=VV2, data=stage10)

Voila, ça devrait marcher.

A priori, deux groupes, donc un test de student est suffisant (selon gg, j'ai découvert ça il y a qq jours...)

Bon courage
Cordialement,

Hadrien

Hadrien35

Nombre de messages : 166
Date d'inscription : 31/03/2011

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Message par Matangi le Sam 13 Aoû 2011 - 2:19

Erf en effet il suffisait de mettre des parenthèses merci pour ton aide

Matangi

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Date d'inscription : 08/07/2010

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