problème avec R : Analyse de données type présence/absence

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Message par soso_4990 le Jeu 11 Nov 2010 - 14:28

Bonjour à tous,

Je doit faire une analyse de l'effet année sur des données type présence/absence (4 années)
Le problème c'est qu'il n'y a pas le même nombre de données dans chaque colonne (le nombre de données manquantes varie beaucoup en fonction des années -> de 29 à 150 donc la différence est loin d'être négligeable) Rolling Eyes

Du coup avec le barplot on dirai que les résultats sont proches mais il y a seulement des nombres de "présents" équivalents et non des proportions équivalentes
(Ex : année 1 -> 340 absents, 236 présent et 29 données manquantes ; année 2 -> 202 absents, 231 présents et 141 données manquantes)

Pour l'instant j'ai juste fait un boxplot sur les % de présence qui ne ressemble à rien (car pas de variance)

Je pense faire un test de chi2 (mais je ne sais pas si R le fait sur le nombre de présence ou s'il prend en compte les proportions)
Quels tests me conseilleriez vous pour cette étude svp car je ne vois pas trop comment faire Sad No

Merci d'avance Wink

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Message par droopy le Jeu 11 Nov 2010 - 15:29

un test de chi² devrait faire l'affaire, par contre il ne se fait pas sur des proportions mais sur une table de contingence, voir ?chisq.test.
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Message par soso_4990 le Jeu 11 Nov 2010 - 16:08

Désolée mais je ne suis pas sur de savoir comment faire
(étant donné que nous commençons tout juste avec R ... Rolling Eyes )

J'ai fais un test de chi2 en suivant un exemple de cours, ce qui m'a donnée ceci :

Données :
année1 : 236 présents, 340 absents et 29 valeurs manquantes
année2 : 313 p, 147 a et 145 vm
année3 : 231 p, 202 a et 171 vm
année4 : 242 p, 325 a et 38 vm

tab<-matrix(c(236,340,313,147,231,202,242,325)ncol=4)
rowname(tab)<-c("présents","absents")
colnames(tab)<-c("annee1","annee2","annee3","annee4")
resultat<-chisq.test(tab)
resultat

j'obtiens X-squared=92.7443, df=3, p-value<2.2e-16


Mais je ne sais pas si dans mon cas ce raisonnement est le bon Question

Merci d'avance

soso_4990

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Message par droopy le Jeu 11 Nov 2010 - 21:29

tout est ok, le code est bon.
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Message par soso_4990 le Ven 12 Nov 2010 - 6:51

Ok merci Very Happy

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