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test de wilcoxon sous R : résultat difficile à interpréter
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test de wilcoxon sous R : résultat difficile à interpréter
Bonjour,
J'ai un souci d'interprétation de résultat suite à la réalisation d'un test de wilcoxon sous R.
J'ai comparé des tailles moyennes de poissons capturés sur deux sites différents aux mois de juin et septembre
Voici mes résultats:
juin :
site 1 : taille moyenne = 133 mm (écart type = 48,4 ; n = 702)
site 2 : taille moyenne = 125 mm (écartype = 36,8 ; n = 403)
pvalue = 0,72
septembre:
site 1 : taille moyenne = 104,4 mm (écart type = 37 ; n = 289)
site 2 : taille moyenne = 105,7 mm (écart type = 31,2 ; n = 222)
pvalue = 0,0006
Quelqu'un peut il m'expliquer le fait que R me trouve une différence significative de taille entre les deux sites au mois de septembre et pas au mois de juin alors que l'écart entre les moyennes est plus important en juin???
D'avance merci pour votre aide....
J'ai un souci d'interprétation de résultat suite à la réalisation d'un test de wilcoxon sous R.
J'ai comparé des tailles moyennes de poissons capturés sur deux sites différents aux mois de juin et septembre
Voici mes résultats:
juin :
site 1 : taille moyenne = 133 mm (écart type = 48,4 ; n = 702)
site 2 : taille moyenne = 125 mm (écartype = 36,8 ; n = 403)
pvalue = 0,72
septembre:
site 1 : taille moyenne = 104,4 mm (écart type = 37 ; n = 289)
site 2 : taille moyenne = 105,7 mm (écart type = 31,2 ; n = 222)
pvalue = 0,0006
Quelqu'un peut il m'expliquer le fait que R me trouve une différence significative de taille entre les deux sites au mois de septembre et pas au mois de juin alors que l'écart entre les moyennes est plus important en juin???
D'avance merci pour votre aide....
pedro64530- Nombre de messages : 7
Date d'inscription : 26/10/2010
Re: test de wilcoxon sous R : résultat difficile à interpréter
Il est impossible de répondre à ta question sans connaître tes données. Il se peut tout simplement que les deux distributions soient plus proches dans le premier cas que dans le deuxième. Une moyenne et un écart type sont relativement peu informatifs car ils vont être sensibles aux valeurs extrêmes. Le test de wilcoxon est basé sur les rangs donc si quelques valeurs extrêmes "gonflent" les moyennes et les variances, une fois passé en rang l'influence des observations sera nettement moindre et au final tu pourras te retrouver avec des tests non significatifs. L'inverse est aussi vrai.
Commence par vérifier que tu ne t'es pas trompé dans la synthaxe que tu as utilisée pour faire le test et compare graphiquement les distributions de tes deux groupes avec par exemple la fonction densityplot.
Commence par vérifier que tu ne t'es pas trompé dans la synthaxe que tu as utilisée pour faire le test et compare graphiquement les distributions de tes deux groupes avec par exemple la fonction densityplot.
droopy- Nombre de messages : 1156
Date d'inscription : 04/09/2009
Re: test de wilcoxon sous R : résultat difficile à interpréter
merci pour la réponse,
peut être que si je calcule la puissance du test, ca sera plus clair???
peut être que si je calcule la puissance du test, ca sera plus clair???
pedro64530- Nombre de messages : 7
Date d'inscription : 26/10/2010
Re: test de wilcoxon sous R : résultat difficile à interpréter
oui tu peux faire ça, mais est-ce que tu as regardé la tête de tes données ?
droopy- Nombre de messages : 1156
Date d'inscription : 04/09/2009
Re: test de wilcoxon sous R : résultat difficile à interpréter
mes données sont distribuées de façon semblable entre mes deux sites en septembre et en juin, la distribution du site 1 est plus étalée avec un deuxième mode pour les grands individus.
Le résultat du test me surprend beaucoup....
Est ce que vous connaissez la commande sous R pour évaluer la puissance du test de wilcoxon???
Le résultat du test me surprend beaucoup....
Est ce que vous connaissez la commande sous R pour évaluer la puissance du test de wilcoxon???
pedro64530- Nombre de messages : 7
Date d'inscription : 26/10/2010
Re: test de wilcoxon sous R : résultat difficile à interpréter
Sans pouvoir visualiser les données il est relativement difficiles de te répondre. Tu as peut-être aussi un problème d'ex-æquo non ?
droopy- Nombre de messages : 1156
Date d'inscription : 04/09/2009
Re: test de wilcoxon sous R : résultat difficile à interpréter
oui effectivement, j'ai beaucoup d'ex aequos au sein d'un même échantillon.
Beaucoup d'individus sont de même taille (environ 5 à 6 individus pour une taille donnée pour les plus représentées).
Beaucoup d'individus sont de même taille (environ 5 à 6 individus pour une taille donnée pour les plus représentées).
pedro64530- Nombre de messages : 7
Date d'inscription : 26/10/2010
Re: test de wilcoxon sous R : résultat difficile à interpréter
Par contre, est ce que le fait d'avoir des échantillons très grands (>200 individus) me donne la possibilité d'utiliser un test T ??
En réalisant un test T, je trouve qu'il n'y a pas de différence significative (pvalue = 0,4 . Ca fait une énorme différence....
En réalisant un test T, je trouve qu'il n'y a pas de différence significative (pvalue = 0,4 . Ca fait une énorme différence....
pedro64530- Nombre de messages : 7
Date d'inscription : 26/10/2010
Re: test de wilcoxon sous R : résultat difficile à interpréter
ah voir, tes données ne sont probablement pas normales. Après il te faut tester l'homogénéité des variances par exemple avec le test de Levene avant d'utiliser le test t.
droopy- Nombre de messages : 1156
Date d'inscription : 04/09/2009
Re: test de wilcoxon sous R : résultat difficile à interpréter
effectivement mes données ne sont pas normales. Je ne peux en aucun cas utiliser le test T ?
pedro64530- Nombre de messages : 7
Date d'inscription : 26/10/2010
Re: test de wilcoxon sous R : résultat difficile à interpréter
il faut voir si elles s'éloignent fortement de la normalité (vraiment asymétrique) et surtout l'homogénéité des variances.
droopy- Nombre de messages : 1156
Date d'inscription : 04/09/2009
Re: test de wilcoxon sous R : résultat difficile à interpréter
J'ai fait un test de Bartlett, il n'y a pas homogénéité des variances et on est éloigné de la normalité (test shapiro pvalue < 2.10-16)
pedro64530- Nombre de messages : 7
Date d'inscription : 26/10/2010
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