test sur deux proportions provenant d'une même population

Bonjour,

J'aimerais faire un test qui me dirait si la différence que j'ai entre mes deux proportions est significative ou non.
Vu que je compare la proportion d'individus ayant eu la maladie A en 2001 avec la proportion d'individus ayant eu cette même maladie A en 2006, j'avais pensé faire un test de Mcnemar pour échantillons appariés. Mais le problème c'est que ce test considère que ma population a le même effectif pour les deux prériodes de temps; ce qui n'est pas mon cas...

Existerait-il un autre test plus adapté à mon problème?

Merci d'avance!

Petites précisions:

-Je dispose d'une grande population (environ 30 000 individus)
-Ma population a baissé de 2500 individus entre 2001 et 2006

Oubliez ma question.

En y repensant bien, ma population a trop changée de 2001 à 2006 pour considérer que j'ai deux échantillons dépendants (c'est la population de travailleurs à temps complet d'une certaine région; il y a eu de la mortalité, des retraites, des nouveau immigrants, des émigrants, des nouveaux venu sur le marché du travail, des travailleurs qui ont décidé de travailler à leur compte, etc...) .

Je vais donc faire un test z pour échantillons indépendant.